Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam43bA2AM80 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms