Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc183A2AJB1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms