Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms