Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrit3W8DXL4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrit3W8DXL4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms