Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vstm4T1NXB5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vstm4T1NXB5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms