Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptgdr2Q9Z2J6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptgdr2Q9Z2J6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms