Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rlbp1Q9Z275 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rlbp1Q9Z275 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rlbp1Q9Z275 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rlbp1Q9Z275 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms