Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trip6Q9Z1Y4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trip6Q9Z1Y4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip6Q9Z1Y4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms