Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VarsQ9Z1Q9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VarsQ9Z1Q9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VarsQ9Z1Q9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms