Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lgr5Q9Z1P4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lgr5Q9Z1P4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Lgr5Q9Z1P4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lgr5Q9Z1P4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms