Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sumo3Q9Z172 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms