Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn1Q9Z0I7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slfn1Q9Z0I7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slfn1Q9Z0I7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfn1Q9Z0I7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms