Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin2Q9WVE8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacsin2Q9WVE8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms