Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcsQ9WU84 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcsQ9WU84 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms