Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam50bQ9WTJ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam50bQ9WTJ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam50bQ9WTJ8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms