Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PplQ9R269 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PplQ9R269 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PplQ9R269 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PplQ9R269 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PplQ9R269 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PplQ9R269 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PplQ9R269 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PplQ9R269 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PplQ9R269 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PplQ9R269 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PplQ9R269 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PplQ9R269 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PplQ9R269 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PplQ9R269 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PplQ9R269 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms