Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfebQ9R210 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TfebQ9R210 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfebQ9R210 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfebQ9R210 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TfebQ9R210 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfebQ9R210 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfebQ9R210 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms