Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Abcc6Q9R1S7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc6Q9R1S7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc6Q9R1S7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc6Q9R1S7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms