Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trex2Q9R1A9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trex2Q9R1A9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms