Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc26a4Q9R155 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc26a4Q9R155 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc26a4Q9R155 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms