Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Lamc3Q9R0B6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lamc3Q9R0B6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lamc3Q9R0B6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lamc3Q9R0B6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms