Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripk3Q9QZL0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ripk3Q9QZL0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk3Q9QZL0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms