Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tcea2Q9QVN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms