Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc42ep4Q9JM96 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc42ep4Q9JM96 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms