Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prg3Q9JL95 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prg3Q9JL95 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms