Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr10Q9JL21 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr10Q9JL21 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr10Q9JL21 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr10Q9JL21 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr10Q9JL21 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr10Q9JL21 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccr10Q9JL21 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccr10Q9JL21 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccr10Q9JL21 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms