Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msgn1Q9JK54 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msgn1Q9JK54 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msgn1Q9JK54 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msgn1Q9JK54 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msgn1Q9JK54 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms