Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng4Q9JJV4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng4Q9JJV4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms