Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ascl3Q9JJR7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ascl3Q9JJR7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ascl3Q9JJR7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ascl3Q9JJR7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms