Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddx21Q9JIK5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx21Q9JIK5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms