Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RabggtaQ9JHK4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RabggtaQ9JHK4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtaQ9JHK4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms