Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Rb1cc1Q9ESK9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Rb1cc1Q9ESK9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Rb1cc1Q9ESK9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms