Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms