Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ripk4Q9ERK0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ripk4Q9ERK0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk4Q9ERK0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms