Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dap3Q9ER88 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dap3Q9ER88 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms