Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chst1Q9EQC0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst1Q9EQC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms