Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Foxp4Q9DBY0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Foxp4Q9DBY0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Foxp4Q9DBY0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Foxp4Q9DBY0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxp4Q9DBY0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms