Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp12Q9D9M2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp12Q9D9M2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp12Q9D9M2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp12Q9D9M2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms