Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4bQ9D9F7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4bQ9D9F7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4bQ9D9F7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4bQ9D9F7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4bQ9D9F7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4bQ9D9F7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4bQ9D9F7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4bQ9D9F7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4bQ9D9F7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Speer4bQ9D9F7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Speer4bQ9D9F7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Speer4bQ9D9F7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms