Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc94Q9D6J3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc94Q9D6J3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms