Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gins2Q9D600 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gins2Q9D600 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gins2Q9D600 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gins2Q9D600 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gins2Q9D600 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gins2Q9D600 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gins2Q9D600 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms