Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn11Q9D572 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ubxn11Q9D572 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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