Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc7Q9D541 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc7Q9D541 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms