Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc83Q9D4V3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc83Q9D4V3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms