Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clvs1Q9D4C9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clvs1Q9D4C9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1003.4 ms