Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx29Q9D3S3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx29Q9D3S3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 614.5 ms