Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4cQ9D3F6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a4cQ9D3F6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms