Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thumpd2Q9CZB3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thumpd2Q9CZB3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms