Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl11Q9CXW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl11Q9CXW4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms