Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc3Q9CW03 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc3Q9CW03 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc3Q9CW03 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms