Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Sycp2Q9CUU3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Sycp2Q9CUU3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Sycp2Q9CUU3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Sycp2Q9CUU3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms